MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 1219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018889	TTTCCT	2	12	116	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679641
3	NC_018889	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	410679641
4	NC_018889	T	6	6	183	188	0 %	100 %	0 %	0 %	410679641
5	NC_018889	AG	3	6	214	219	50 %	0 %	50 %	0 %	410679641
6	NC_018889	GA	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	410679641
7	NC_018889	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
8	NC_018889	AGC	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
9	NC_018889	AAG	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679641
10	NC_018889	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679641
11	NC_018889	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679641
12	NC_018889	GTCGAT	2	12	602	613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410679641
13	NC_018889	ACA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679641
14	NC_018889	TTTTA	2	10	679	688	20 %	80 %	0 %	0 %	410679641
15	NC_018889	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679641
16	NC_018889	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	410679641
17	NC_018889	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679641
18	NC_018889	CTT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679641
19	NC_018889	ATTTCA	2	12	910	921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410679641
20	NC_018889	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679641
21	NC_018889	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679641
22	NC_018889	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	410679641
23	NC_018889	GCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
24	NC_018889	ATGTT	2	10	1089	1098	20 %	60 %	20 %	0 %	410679641
25	NC_018889	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	410679641
26	NC_018889	CTGAA	2	10	1185	1194	40 %	20 %	20 %	20 %	410679641
27	NC_018889	GT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	410679641
28	NC_018889	A	6	6	1367	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	410679641
29	NC_018889	GAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679641
30	NC_018889	A	6	6	1523	1528	100 %	0 %	0 %	0 %	410679641
31	NC_018889	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679641
32	NC_018889	A	8	8	1647	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	410679641
33	NC_018889	TTG	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679641
34	NC_018889	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
35	NC_018889	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	410679641
36	NC_018889	AGT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679641
37	NC_018889	AATT	2	8	1934	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018889	ACA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679642
39	NC_018889	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679642
40	NC_018889	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018889	A	8	8	2147	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	410679643
42	NC_018889	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	410679643
43	NC_018889	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679643
44	NC_018889	TAT	3	9	2406	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679643
45	NC_018889	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	410679643
46	NC_018889	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679643
47	NC_018889	TTA	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679643
48	NC_018889	TGG	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679643
49	NC_018889	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679643
50	NC_018889	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679643
51	NC_018889	ATT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679643
52	NC_018889	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	410679643
53	NC_018889	AAG	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679643
54	NC_018889	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	410679643
55	NC_018889	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679643
56	NC_018889	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018889	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679644
58	NC_018889	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679644
59	NC_018889	CTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679644
60	NC_018889	CGA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679644
61	NC_018889	TTC	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679644
62	NC_018889	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679644
63	NC_018889	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	410679644
64	NC_018889	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	410679644
65	NC_018889	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	410679644
66	NC_018889	T	7	7	3378	3384	0 %	100 %	0 %	0 %	410679644
67	NC_018889	AGA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679644
68	NC_018889	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679645
69	NC_018889	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	410679645
70	NC_018889	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	410679645
71	NC_018889	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679645
72	NC_018889	TCG	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679645
73	NC_018889	T	7	7	3892	3898	0 %	100 %	0 %	0 %	410679645
74	NC_018889	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	410679645
75	NC_018889	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	410679645
76	NC_018889	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679645
77	NC_018889	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679645
78	NC_018889	T	6	6	4112	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	410679645
79	NC_018889	T	7	7	4190	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	410679645
80	NC_018889	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	410679645
81	NC_018889	T	6	6	4204	4209	0 %	100 %	0 %	0 %	410679645
82	NC_018889	TTG	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679645
83	NC_018889	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	410679645
84	NC_018889	AATTC	2	10	4320	4329	40 %	40 %	0 %	20 %	410679645
85	NC_018889	CAT	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679645
86	NC_018889	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018889	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679646
88	NC_018889	TTC	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
89	NC_018889	TCT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
90	NC_018889	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	410679646
91	NC_018889	CTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
92	NC_018889	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	410679646
93	NC_018889	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	410679646
94	NC_018889	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679646
95	NC_018889	AT	3	6	4802	4807	50 %	50 %	0 %	0 %	410679646
96	NC_018889	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	410679646
97	NC_018889	GAC	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679646
98	NC_018889	TG	3	6	4983	4988	0 %	50 %	50 %	0 %	410679646
99	NC_018889	TAC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679646
100	NC_018889	TTTC	2	8	5212	5219	0 %	75 %	0 %	25 %	410679646
101	NC_018889	TTC	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
102	NC_018889	T	6	6	5339	5344	0 %	100 %	0 %	0 %	410679646
103	NC_018889	AAT	2	6	5399	5404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679646
104	NC_018889	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
105	NC_018889	AGG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679646
106	NC_018889	TC	4	8	5444	5451	0 %	50 %	0 %	50 %	410679646
107	NC_018889	ATA	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679646
108	NC_018889	TCAT	2	8	5556	5563	25 %	50 %	0 %	25 %	410679646
109	NC_018889	GTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679646
110	NC_018889	GAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018889	CAAG	2	8	5835	5842	50 %	0 %	25 %	25 %	410679647
112	NC_018889	ATTA	2	8	5853	5860	50 %	50 %	0 %	0 %	410679647
113	NC_018889	ATAA	2	8	5868	5875	75 %	25 %	0 %	0 %	410679647
114	NC_018889	TTA	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018889	ACA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018889	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018889	T	6	6	6017	6022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018889	AG	4	8	6055	6062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018889	A	7	7	6069	6075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018889	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018889	AGAA	2	8	6122	6129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018889	TGA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679648
123	NC_018889	A	7	7	6157	6163	100 %	0 %	0 %	0 %	410679648
124	NC_018889	T	7	7	6170	6176	0 %	100 %	0 %	0 %	410679648
125	NC_018889	T	6	6	6184	6189	0 %	100 %	0 %	0 %	410679648
126	NC_018889	TTC	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679648
127	NC_018889	CCACT	2	10	6373	6382	20 %	20 %	0 %	60 %	410679648
128	NC_018889	T	6	6	6382	6387	0 %	100 %	0 %	0 %	410679648
129	NC_018889	T	6	6	6438	6443	0 %	100 %	0 %	0 %	410679648
130	NC_018889	ACAAAA	2	12	6459	6470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410679648
131	NC_018889	CAA	2	6	6514	6519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679648
132	NC_018889	GAA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
133	NC_018889	A	6	6	6559	6564	100 %	0 %	0 %	0 %	410679649
134	NC_018889	AAGA	2	8	6579	6586	75 %	0 %	25 %	0 %	410679649
135	NC_018889	A	7	7	6588	6594	100 %	0 %	0 %	0 %	410679649
136	NC_018889	CAAA	3	12	6600	6611	75 %	0 %	0 %	25 %	410679649
137	NC_018889	TTC	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679649
138	NC_018889	TTATC	2	10	6634	6643	20 %	60 %	0 %	20 %	410679649
139	NC_018889	ATC	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679649
140	NC_018889	ATT	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679649
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